Trainer: Heribert Deutinger (bis 19.03.2007), Werner Lorant (ab 23.03.2007)
Abschlusstabelle – 2. Bundesliga:
| Pl. | Verein | Sp. | g. | u. | v. | Tore | Diff. | Pkte. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Karlsruher SC | 34 | 21 | 7 | 6 | 69:41 | +28 | 70 |
| 2. | FC Hansa Rostock | 34 | 16 | 14 | 4 | 49:30 | +19 | 62 |
| 3. | MSV Duisburg | 34 | 16 | 12 | 6 | 66:40 | +26 | 60 |
| 4. | SC Freiburg | 34 | 17 | 9 | 8 | 55:39 | +16 | 60 |
| 5. | SpVgg Greuther Fürth | 34 | 16 | 6 | 12 | 53:40 | +13 | 54 |
| 6. | 1. FC Kaiserslautern | 34 | 13 | 14 | 7 | 48:34 | +14 | 53 |
| 7. | FC Augsburg | 34 | 14 | 10 | 10 | 43:32 | +11 | 52 |
| 8. | TSV 1860 München | 34 | 14 | 6 | 14 | 47:49 | -2 | 48 |
| 9. | 1. FC Köln | 34 | 12 | 10 | 12 | 49:50 | -1 | 46 |
| 10. | FC Erzgebirge Aue | 34 | 13 | 6 | 15 | 46:48 | -2 | 45 |
| 11. | SC Paderborn 07 | 34 | 11 | 9 | 14 | 32:41 | -9 | 42 |
| 12. | TuS Koblenz | 34 | 11 | 8 | 15 | 36:45 | -9 | 41 |
| 13. | FC Carl Zeiss Jena | 34 | 9 | 11 | 14 | 40:56 | -16 | 38 |
| 14. | Kickers Offenbach | 34 | 9 | 9 | 16 | 42:59 | -17 | 36 |
| 15. | Rot-Weiss Essen | 34 | 8 | 11 | 15 | 34:40 | -6 | 35 |
| 16. | SpVgg Unterhaching | 34 | 9 | 8 | 17 | 33:49 | -16 | 35 |
| 17. | SV Wacker Burghausen | 34 | 7 | 11 | 16 | 42:63 | -21 | 32 |
| 18. | Eintracht Braunschweig | 34 | 4 | 11 | 19 | 20:48 | -28 | 23 |
Begegnungen - 2. Bundesliga:
- 13.08.2006 FC Erzgebirge Aue 1 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 20.08.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 1 MSV Duisburg 2. Bundesliga
- 25.08.2006 SC Freiburg 1 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 15.09.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 1 FC Augsburg 2. Bundesliga
- 24.09.2006 Kickers Offenbach 1 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 29.09.2006 SpVgg Unterhaching 1 - 1 1. FC Kaiserslautern 2. Bundesliga
- 15.10.2006 FC Carl Zeiss Jena 0 - 2 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 20.10.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 0 1. FC Köln 2. Bundesliga
- 29.10.2006 SC Paderborn 07 2 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 03.11.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 2 SV Wacker Burghausen 2. Bundesliga
- 07.11.2006 Eintracht Braunschweig 2 - 3 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 12.11.2006 SpVgg Unterhaching 2 - 1 Rot-Weiss Essen 2. Bundesliga
- 19.11.2006 TuS Koblenz 0 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 26.11.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 1 Karlsruher SC 2. Bundesliga
- 03.12.2006 SpVgg Unterhaching 5 - 1 TSV 1860 München 2. Bundesliga
- 10.12.2006 SpVgg Greuther Fürth 1 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 15.12.2006 SpVgg Unterhaching 0 - 0 FC Hansa Rostock 2. Bundesliga
- 19.01.2007 SpVgg Unterhaching 1 - 1 FC Erzgebirge Aue 2. Bundesliga
- 28.01.2007 MSV Duisburg 4 - 2 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 04.02.2007 SpVgg Unterhaching 0 - 2 SC Freiburg 2. Bundesliga
- 09.02.2007 FC Augsburg 2 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 16.02.2007 SpVgg Unterhaching 2 - 0 Kickers Offenbach 2. Bundesliga
- 25.02.2007 1. FC Kaiserslautern 4 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 02.03.2007 SpVgg Unterhaching 2 - 0 FC Carl Zeiss Jena 2. Bundesliga
- 11.03.2007 1. FC Köln 4 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 18.03.2007 SpVgg Unterhaching 0 - 3 SC Paderborn 07 2. Bundesliga
- 30.03.2007 SV Wacker Burghausen 4 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 08.04.2007 SpVgg Unterhaching 3 - 2 Eintracht Braunschweig 2. Bundesliga
- 15.04.2007 Rot-Weiss Essen 1 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 22.04.2007 SpVgg Unterhaching 1 - 0 TuS Koblenz 2. Bundesliga
- 29.04.2007 Karlsruher SC 1 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 06.05.2007 TSV 1860 München 1 - 0 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga
- 13.05.2007 SpVgg Unterhaching 2 - 1 SpVgg Greuther Fürth 2. Bundesliga
- 20.05.2007 FC Hansa Rostock 3 - 1 SpVgg Unterhaching 2. Bundesliga